Copiamos el playerglobal.swc del player 10 que se encuentra en:
Applications/Adobe/Flash/CS4/Common/Configuration/ActionScript/3.0/FP10/playerglobal.swc
Creamos una carpeta con el nombre "10" en la carpeta de plugins de eclipse:
Applications/eclipse/plugins/com.powerflasher.fdt.shippedflex_3.1.0.2710_0001/flex/frameworks/libs/player
y pegamos dentro el playerglobal.swc
Después abrimos Eclipse, vamos a preferencias y en la pestaña FDT seleccionamos Core Libraries.

En las core libraries de AS3 añadimos una nueva.

El tipo Pure AS3 Flex, nombre FP10 y en Path Variable creamos una nueva variable con el path:
Applications/eclipse/plugins/com.powerflasher.fdt.shippedflex_3.1.0.2710_0001/flex

Por último dentro del archivo .project (archivo oculto) de nuestro proyecto FDT cambiamos la línea LocationURI, poniendo 10 donde se encuentra el 9.

Reiniciamos Eclipse y listo.